Depende de como esté configurado la terminal y el editor. Si está en latin1 (o iso8859-1) en el preámbulo se escribe:
\usepackage[latin1]{inputenc}
Si está en utf 8 (unicode):
\usepackage[utf8]{inputenc}
O usar el mecanismo básico de LATEX como \'a, \'e,
\'{\i}, \'o, \'u, \~n.